CV

Chercheur CNRS actuellement en mise à disposition au laboratoire LITO U1288 INSERM, Institut Curie, Paris

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mariée, deux enfants

EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE

  • depuis janvier 2021 : Chercheur CNRS (INS2I, section 7), LITO U1288 INSERM, Institut Curie, Université Paris Saclay (Mise à disposition financée par le CNRS pour une durée d'un an pour terminer des travaux sur l'évaluation et la fusion des méthodes de segmentation).

  • 2012-2020 : Chercheur CNRS (Section 7), GREYC UMR CNRS 6072 Caen
    • 2017-2020 : Congé longue maladie (maladie de Lyme) : Maintien d'une page facebook non lucrative collaborative pour informer sur la maladie de Lyme, lutter contre le terrorisme et la désinformation, cybersécurité, aide aux enfants avec la communauté Fortnite,  Mindfulness et gestion du stress
  • 2008-2012 : Chercheur CNRS (Section 7), LIMOS UMR CNRS 6158 Clermont-Ferrand
  • 2003-2008 : Maître de Conférences (Section 61) à l'ENSICAEN, école d'ingénieurs de Caen

FORMATION

  • 1999-2003 : Doctorat en Traitement des images et des vidéos, Laboratoire I3S Université de Nice Sophia Antipolis, "Modèles de contours actifs basés régions pour la segmentation d'images et de vidéos", Encadrement : Michel Barlaud et Gilles Aubert
    • Manuscrit disponible ICI
  • 1998-1999 : Master Recherche DEA ARAVIS (Algorithmique, Robotique, Automatique, Vision, Image et Signal), Université de Nice Sophia Antipolis
  • 1993-1996 : Ingénieur généraliste École Centrale de Nantes (Mention très bien), dernière année effectuée à l'École Centrale Paris
  • 1991-1993 : Classes Préparatoires aux grandes écoles (Lycée Sainte Geneviève, Versailles) 

RECHERCHE SCIENTIFIQUE 

Principaux axes : 

  • Approches variationnelles, EDPs et contours actifs pour la segmentation d'images et de vidéos
  • Optimisation de domaines et gradients de forme appliqués à la segmentation et au suivi de région d'intérêts
  • Contours actifs basés régions statistiques basés sur l'optimisation de divergences entre densités de probabilité paramétriques et non paramétriques
  • Optimisation convexe et approches duales pour le filtrage d'images noir et blanc et couleur et pour la segmentation
  • Évaluation des méthodes de segmentation sans gold standard par définition d'une forme mutuelle (théorie de l'information)
  • Inégalités statistiques pour la segmentation et la mise en correspondance de régions
Principales applications :
  • Segmentation et suivi dans les images et les vidéos (Projet européen COST 211, collaboration Orange)
  • Amélioration de séquences vidéo (collaboration NXP)
  • Segmentation en échocardiographie (collaboration CHU de Caen)
  • Analyse spatio-temporelle en IRM de perfusion (collaboration General Electric)
  • Estimation de mouvement fluide avec application à la segmentation (ANR STANDS MSG)
  • Segmentation et restauration d'images patrimoniales couleur de documents anciens (collaboration MRSH de Caen)
  • Évaluation des méthodes de segmentation en imagerie médicale (action IMPEIC GDR STIC Santé)
  • Réalité augmentée pour l'héritage culturel (collaboration avec le XLIM Poitiers)

PUBLICATIONS 

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Liste des publications et séminaires sur la page Publications de ce blog

1 Brevet européen et américain avec NXP, 4 chapitres de livre

Prix obtenus :

  • Best Paper Award pour [VISAPP-2010]: "Fast dual minimization of weighted TV+L1 norm for salt and pepper noise removal", S. Jehan-Besson, J. Koko, International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Angers, France, mai 2010
  • Papier classé dans le Top 10% des papiers publiés à ICIP 2014 :`A mutual reference shape based on information theory'', S. Jehan-Besson, C. Tilmant, A. de Cesare, A. Lalande, A. Cochet, J. Cousty, J. Lebenberg, M. Lefort, P. Clarysse, R. Clouard, L. Najman, L. Sarry, F. Frouin, M. Garreau, IEEE International Conference on Image Processing ICIP, pp. 887-891, Paris, France, 2014.

RESPONSABILITÉS ADMINISTRATIVES 

Responsable de l'axe Analyse et Traitement des images de la Fédération NORMASTIC de 2015 à 2017 

  • Participation à la rédaction du rapport d'activité pour l'HCERES (2015).
  • Participation à la réflexion autour des appels à projets dans le cadre de NORMASTIC
  • Co-organisation d'une journée pour l'axe Images avec Su Ruan en lien avec le GDR ISIS le 27 octobre 2016 : ``Méthodes d'apprentissage statistiques et applications à la santé''.
  • Co-organisation d'une journée jointe avec la fédération Normandie Mathématiques avec C. Le Guyader (LMI, Rouen) le 27 janvier 2017 : ``Méthodes variationnelles et statistiques appliquées au traitement d'images''.
  • Co-encadrement d'un stage de Master en 2016 (collaboration GREYC-LITIS) 

Relecteur de revues scientifiques (liste à partir de 2009)

  • Traitement du Signal, Lavoisier (2 en 2012, 1 en 2015, 1 en 2017)

  • Pattern Recognition (1 en 2010, 2 en 2013)

  • Journal of Mathematical Imaging and Vision (2013)

  • IEEE Transactions on Medical Imaging (2011)

  • IEEE Transactions on Image Processing (2010)

  • IEEE Transactions on Systems, Man and Cybernetics (2009)

  • Computer Vision and Image Understanding (2010,2014,2015)

  • IRBM Innovation and Research in BioMedical Engineering (2015)

Participation à des comités de programme (conférences nationales et internationales), liste à partir de 2009
  • ICCV (Int. Conf. on Computer Vision) en 2009

  • CVPR (IEEE Int. Conf. on Computer Vision and Pattern Recongnition) en 2010

  • RFIA (Conf. Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle) en 2012 / 2014 / 2016

  • ICISP (Int. Conf. on Image and Signal Procesing) en 2008, 2010, 2012 et 2014

  • Membre du comité d'organisation d'ORASIS 2017 

Membres de commission de spécialistes pour recrutement de maîtres de conférences 

  • Université de Caen (2 maîtres de conférence section 61 en 2007 et 2008),
  • Université de Nice Sophia Antipolis (1 maître de conférence section 61 en 2011)
  • IUT de Rouen (1 maître de conférence section 61 en 2014)
  • INSA de Lyon (1 maître de conférence section 61 en 2016) 
Jurys de thèse
  • Rapporteur pour la thèse de M. Dimicolli : ``Monocular depth estimation for image segmentation and filtering'', Université de Barcelone, octobre 2009.  
    • Jury : F. Marquès (Univ. de Barcelone - Président), L. Moisan (Laboratoire MAP5, Paris - Rapporteur), S. Jehan-Besson (Laboratoire LIMOS - Rapporteur), D. Bennequin (Institut de Mathématique, Paris - Examinateur), P. Salembier (Univ. de Barcelone - Directeur de thèse).
  • Examinateur pour la thèse de Julien Wojak "Analyse d'images multimodales TEP-TDM du thorax : Application à l'oncologie : segmentation de tumeurs, d'organes à risque et suivi longitudinal pour la radiothérapie", Telecom Paris, décembre 2010. 
    • Jury : E. Angelini (Télécom Paristech - Directrice de thèse), I. Bloch (Télécom ParisTech - Directrice de thèse), P. Charbonnier (LCPC Strasbourg - Rapporteur), C. Odet (INSA Lyon - Rapporteur), G. Malandain (INRIA Sophia Antipolis - Président), R. Trebossen (CEA Saclay - Examinatrice), S. Jehan-Besson (LIMOS, Examinatrice).

ENCADREMENT 

Co-encadrements de thèses ou post-doctorats :

  • Co-direction avec M. Revenu (Pr. GREYC) et M. Duranton (NXP) de la thèse M. Elhassani, thèse CIFRE avec NXP : "Segmentation basée-région pour l'amélioraton de séquences vidéos : Algorithme-Architecture dans un contexte temps réel'', soutenue le 9 juin 2008 avec la mention Très Honorable.
    •  Jury de thèse : Michel Barlaud (Laboratoire I3S, Rapporteur), Olivier Desforges (INSA Rennes, Rapporteur), Luc Brun (GREYC, Examinateur), Marc Duranton (NXP Semiconducteurs, Examinateur), Delphine Rivasseau (NXP Semiconducteurs, Invité), Philippe Salembier (Université de Barcelone, Examinateur), Stéphanie Jehan-Besson (GREYC, Co-directrice de thèse), Marinette Revenu (GREYC, directrice de thèse). 
    • Publications: [ICECS-06, ICIS-06, VLSI-08, BREVET-1]
  • Co-direction avec J.Fadili (GREYC) et M. Revenu (Pr. GREYC) de la thèse de F. Lecellier, BDI CNRS en collaboration avec le CHU de Caen : "Contours actifs basés régions avec a priori de bruit, de forme et de texture : Application à l'échographie cardiaque'', soutenue le 15 mai 2009 avec la mention Très Honorable. 
    • Jury de thèse : Jean-Philippe Thiran (EPFL Lausanne, Rapporteur), Luminita Vese (UCL USA, Rapporteur), Gilles Aubert (Laboratoire J.A. Dieudonné, Examinateur), Nikos Paragios (Ecole Centrale Paris, Examinateur), Stéphanie Jehan-Besson (GREYC, Co-directrice de thèse), Jalal Fadili (GREYC, Co-directeur de thèse), Marinette Revenu (GREYC, Directrice de thèse), Eric Saloux (CHU de Caen, Invité). F. Lecellier est actuellement maître de conférence au XLIM à Poitiers. 
    • Publications: [ICASSP-06, ICIP-06, ICPR-08, SSVM-09, RITS-09, JMIV-10-1]
  •  Co-direction avec J. Koko (MCF HDR LIMOS) de la thèse de C.Loosli, BDI CNRS cofinancée région Auvergne : "Les méthodes duales appliquées à la restauration et la segmentation'' de octobre 2010 à octobre 2013. C. Loosli est musicien et s'est orienté dans cette direction.
    • Publications: [IMACS-11, GRETSI-11a, CPCV-12, CAIP-13], 1 soumission à SIAM journal on Imaging Sciences en 2013.
  • Encadrement dans le cadre de l'ANR STANDS MSG du post-doctorat de Y. Bachalany en collaboration avec T. Corpetti, "Estimation du mouvement fluide avec application à la segmentation de cellules convectives dans les images météorologiques'' de mai 2009 à août 2009
  • Encadrement du CDD Ingénieur de Thomas Blanquet, "Segmentation supervisée et non supervisée d'images patrimoniales couleur", approches duales et optimisation convexe, Laboratoire GREYC, contrat dans le cadre du CPER NUMNIE en lien avec la MRSH (Maison de la Recherche en Sciences Humaines) de Caen de janvier 2017 à juin 2017.

Encadrement de stages 

  • 2004 : Co-encadrement du stage de Master (Master of Computer Science, Université de Freiburg, Allemagne) de Stefan Duffner au Laboratoire GREYC : Estimation du mouvement dans les séquences d'images et segmentation des vecteurs mouvement en utilisant un critère basé sur l'entropie et des densités de probabilités jointes non paramétriques.
  • 2004 : Co-encadrement du stage de DEA (DEA ESCI Université de Caen de Mohammed Boukelia en collaboration avec J. Fadili (GREYC) au Laboratoire GREYC : Extension des modèles de contours actifs basés régions à l'étude des familles exponentielles.
  • 2005 : Co-encadrement du stage de Master (Master LID, Université de Caen) de F. Lecellier en collaboration avec J. Fadili (GREYC) et M. Revenu (GREYC) au laboratoire GREYC : Segmentation de séquences d'images d'échocardiographie par contours actifs basés régions.
  • 2006 : Co-encadrement du stage Ingénieur 2A (ENSICAEN) de R. Bourjas en collaboration avec F. Lecellier (Doctorant GREYC) au laboratoire GREYC : Optimisation des contours actifs, 3D
  • 2006 : Co-encadrement du stage Ingénieur 2A (ENSICAEN) de M. Ghoniem en collaboration avec M. Revenu au laboratoire GREYC : Segmentation et analyse d'IRMs cardiaques basés sur les histogrammes.
  • 2007 : Co-encadrement du stage Ingénieur 2A (ENSICAEN) de G. Person en collaboration avec F. Lecellier (Doctorant GREYC) au laboratoire GREYC : Segmentation de séquences d'images et d'images 3D par la méthode des contours actifs basés régions.
  • 2016 : Co-encadrement du stage de Mastère spécialisé (Master ATRIVM, ENSICAEN) de T. Blanquet en collaboration avec F. Lecellier (XLIM, Poitiers) au laboratoire GREYC (financement FEDER du XLIM) : Segmentation d'images couleur patrimoniales 
  • 2016 : Co-encadrement du stage de Master modélisation mathématiques pour les sciences de l'ingénieur (Université de Reims Champagne-Ardenne) de K. Gosse en collaboration avec S. Ruan (LITIS, Rouen) au laboratoire GREYC (financement fédération NORMASTIC) : Segmentation automatique de tumeurs en imagerie par émission de positons.

COLLABORATIONS INDUSTRIELLES ET ACADÉMIQUES

Contrats industriels : 
  • General Electric, Paris (thèse région-entreprise de G. Née 2006-2010)
    • Publications: [JRIM-07, SSPR-08, EMBS-09, CAIP-09, CHAPTER-10]

  • NXP, Caen (thèse CIFRE de M. Elhassani 2004-2008)
    • Publications: [ICECS-06, ICIS-06, VLSI-08, BREVET US PATENT]
Participation à différents projets de recherche 
  •  Groupe de travail ``Masse de Données et Patrimoine''  document numérique et préservation du patrimoine en Normandie
  • Action IMPEIC puis MedIEval du GDR STIC Santé : ``Comparaison de méthodes d'évaluation : Application à la segmentation de structures cardiaques en imagerie multi-modalités'' 
  • ANR Jeunes Chercheurs STANDS-MSG : Spatio-temporal Analysis of Deformable Structures in Meteo-Sat Second Generation Images», porteur de l'ANR : Thomas Corpetti LETG UMR 6554, Rennes 
  • Participation au montage d'un Projet International de Coopération Scientifique CNRS (PICS) porté par S. Ruan sur la segmentation de tumeurs.Ce projet rassemblait l'équipe Quantif du LITIS, des chercheurs de l'université de Tianjin en Chine et des chercheurs de l'équipe Image du GREYC (L. Brun, S. Jehan-Besson).
  • Participation au montage de l'ANR VSTRAIN3D pour l'appel d'offre Technologies pour la Santé de l'ANR dont le porteur était Laurent Sarry de l'ISIT (partenaires : L. Sarry (ISIT, Clermont-Ferrand), J. Koko et P. Chainais (LIMOS, Clermont-Ferrand), R. Touzani et P. Bouchon (Laboratoire de Mathématiques de Clermont-Ferrand), C. Tilmant (LASMEA, Clermont-Ferrand)).
  • Participation à l'élaboration d'un projet européen INTERREG Atlantico porté par F. Lecellier (XLIM) soumis en juin 2016. Ce projet intitulé projet ARCH (Augmented Reality for Cultural Heritage, a new way of experiencing patrimony) portait sur le développement d'applications interactives pour la visite de musées. 

Valorisation de logiciels - brevets

  • Brevet avec NXP : ``Adaptive Peaking'' et ``Pixel Processing'', M. Elhassani, M. Duranton, S. Jehan-Besson. EP Patent 07291192.8 (10/2008), US Patent (07/2010) 12681366, US granted patent US 8478065 B2 (07/2013).
  •  Accord de confidentialité C13657-NDA passé entre le CNRS et l'Université Pierre et Marie Curie (F. Frouin LIF INSERM UMR 678) (juillet 2013-juillet 2014). Cet accord portait sur l'évaluation de l'algorithme d'estimation de forme mutuelle que j'ai développé dans le cadre du projet IMPEIC dirigé par F. Frouin. 

ENSEIGNEMENT  et DIFFUSION SCIENTIFIQUE

Enseignements en tant que Chercheur CNRS (2008-2017)

Master recherche LID (Université de Caen), ENSICAEN :

  •  Cours Morphologie mathématique (2010-2012) : CM : 6h (responsable du module), polycopié 

Master 2 IMALANG (Université de Caen), ENSICAEN 3A majeure Image:

  • Cours Segmentation et Analyse Vidéo
    • Contenu : formats vidéos, estimation de mouvement, algorithmes de traitement de vidéos, compression avancée de vidéos, contours actifs
    • Rédaction d'un polycopié pour ce cours et des TPs associés
    • (2012-2013) : CM : 6h
    • (2013-2015) : CM : 10h
    • (2015-2017) : CM : 10h + TD : 1h

Travaux pratiques, ENSICAEN 3A et Master 2 ImaLang Université de Caen:

  •  Montage et encadrement de plusieurs sujets de TPs dans le cadre du cours sur la Segmentation et l' Analyse Vidéo
    • (2010-2012) : TP : 10h
    • (2013-2016) : TP : 20h (2 groupes) 
    • (2016-2017) : TP : 10h

Travaux pratiques, ENSICAEN 1A:

  •  Travaux pratiques Algorithmique avancé
    • 2012-2013 : TP/TD : 28h
    • 2013-2014 : TP/TD : 56h
    • 2014-2015 : TP/TD : 28h

Encadrement de projet fin de cycles : quelques exemples

  • ISIMA 3A : Projet sur l'estimation d'une forme moyenne par contours actifs} (2009-2010) (eq. TD : 6h)
  • ENSICAEN 3A : Projet sur la restauration numérique des manuscrits du Mont Saint Michel avec la MRSH} (2012-2013) (eq. TD : 6h)
  • ENSICAEN 3A : Projet sur l'édition augmentée d'un ouvrage numérisé par la MRSH } (2015-2016) (eq. TD : 6h)
  • Mastère spécialisé ATRIVM (ENSICAEN) : Projet sur la stéréovision pour la vidéo-surveillance (2015-2016) (eq. TD : 6h)

Enseignements en tant que Maître de Conférences ENSICAEN (2003-2008)

Les principaux enseignements ont concerné :

  •  Responsable du module de 3ème année : Morphologie mathématique (CM : 8h)
  • Responsable du module de 3ème année : Analyse et Diffusion de Vidéos (CM : 10h, TPs : 12h)
  • TDs et TPs d'Algorithmique et Programmation (Langage C, C++, Java)

  • TPs de Traitement d'images (dont restauration par EDPs)
  • Encadrement de projets de 2ème et 3ème année en option Image (Comparaison d'un codeur MPEG-2 et H.264, Calcul d'images panoramiques, segmentation d'images médicales ...)

Diffusion scientifique

  • participation à la fête de la science (démonstration, stand),
  • encadrement de stagiaires de collège
  • participation au jury des olympiades sciences de l'ingénieur (lycéens)
  • participation au concours CGénial (Collégiens)

 

 

 

 

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